游戏简介
聚类分析软件(1.2版)是一个简单实用的聚类数据分析软件。通过该软件,用户可以分析相应的实验数据。该软件提供了多种数据计算方法,包括计算杂合度、计算多态性、计算欧氏距离和执行聚类计算。你可以根据实验数据的类型来选择。该软件主要用于计算杂合度、多态信息含量、遗传距离和聚类分析,适用于血型、蛋白质多态性、品种聚类等。各种数据按Nei公式(1974)进行分析计算。计算完成后,系统自动判断当前所有矩阵包含的数据,并导出为Excel文件,方便用户保存和使用。有需要的朋友可以赶紧下载试试!
软件功能
定义矩阵:定义数据矩阵的大小,用“长宽”表示,X轴方向为变化量,Y轴为数据量;用罗杰公式计算遗传距离时只需根据需要输入分类号(位数),系统默认值为“1”。如果输入“5”“4”和“2”,则表示有5个品种,4行数据,2个基因位点。该系统支持多达255个品种和9999条数据。
输入数据:根据定义的矩阵创建一个空白矩阵;如果没有定义矩阵大小,则根据当前矩阵的大小创建一个空白矩阵。
读入数据:通过“保存矩阵”命令将保存在磁盘上的数据读入系统,系统会自动创建一个大小与之对应的矩阵,并读取所有数据。
附加数据:在当前矩阵的末尾继续添加一个保存的数据,主要用于计算遗传距离。
读入遗传距离:读入保存在磁盘上的遗传距离数据,可直接用于聚类计算。
数据归一化:当前矩阵中的数据按照“标准差标准化法”进行处理。注意:单击此命令后,处理后的数据将用于计算遗传距离和聚类。只有重新读取或查看原始数据后,才会恢复原始数据,然后根据原始数据计算遗传距离和聚类计算。
杂合度的计算:根据Nei's公式(1974)计算各品种的杂合度。
计算多态性:根据Nei的公式(1974)计算每个品种的多态性信息量。
欧氏距离的计算:将数据读入系统后,可以使用该命令根据罗杰公式计算品种间的遗传距离。注意:如果类别数(等位基因数)没有在定义矩阵中定义,系统默认为1。在这种情况下,计算的遗传距离与Mahalanobis公式计算的遗传距离相同。未注册用户最后三个品种的遗传距离不显示。
遗传距离的计算:将所有数据读入系统后,可以使用该命令根据Nei's公式(1983)计算品种间的遗传距离。未注册用户最后三个品种的遗传距离不显示。
聚类计算:在计算或读入遗传距离后,可以使用该命令根据P.H.A.Sneath等人(1973)的类平均聚类法(UPGMA法,也称为未加权算术平均配对聚类法)进行系统聚类。聚类结果显示,第一列的数字是序号,。。聚类时间。第二列d是距离系数;第3列和第4列breed1和breed2是参与聚类的两个品种,第5列Cluster是聚类后的新名称,第6列Content是两个品种的名称。未注册用户的最后3个聚类结果不会显示。
查看原始数据:将原始数据读入当前矩阵。并且标准化的数据被清除。
查看遗传距离:在当前矩阵中显示读取的遗传距离或计算的遗传距离。
查看聚类图:根据聚类后的结果自动绘制聚类图。
保存聚类图:将显示的聚类图作为图像文件保存到磁盘。未注册用户没有此功能!
保存矩阵:将当前矩阵保存到磁盘。如果当前矩阵是原始数据,则保存原始数据;如果是归一化数据,保存处理后的数据;如果是杂合性,杂合性保存;如果它是聚类res
数据导出:系统自动判断当前所有矩阵中包含的数据,并导出为Excel文件。未注册用户没有此功能!
安装方法
1.下载解压后的文件,找到JLFX.EXE,双击安装。
2.进入安装界面,点击下一步安装。
3.选择安装目录D:tools Desktop pc0359,用户也可以自行更改其他安装位置。
4.创建菜单文件夹聚类分析,可以帮助用户快速找到软件的位置。
5、创建桌面快捷方式,可以快速打开桌面上的软件,点击是。
6、安装预览,可以查看所有的安装信息。单击“上一步”进行修改。
7.安装正在进行,请稍候。
使用方法
1.安装完成后,点击桌面上的软件,打开如图所示的界面。
2.点击矩阵大小,可以控制数据矩阵,定义数据矩阵的大小,用“长宽”表示,X轴方向为变化量,Y轴为数据量;用罗杰公式计算遗传距离时只需根据需要输入分类号(位数),系统默认值为“1”。如果输入“5”“4”和“2”,则表示有5个品种,4行数据,2个基因位点。该系统支持多达255个品种和9999条数据。
3.输入数据,将您的分析数据文件导入软件进行分析,并根据定义的矩阵创建空白矩阵。如果未定义矩阵大小,则根据当前矩阵大小创建一个空白矩阵。
4.数据归一化,可以自动对数据进行排版,并按照标准差标准化方法对当前矩阵中的数据进行处理。注意:单击此命令后,处理后的数据将用于计算遗传距离和聚类。只有重新读取或查看原始数据后,才会恢复原始数据,然后根据原始数据计算遗传距离和聚类计算。
5.计算命令。可以点击不同的计算项进行数据分析,有计算杂合度、计算多态性、计算欧氏距离、聚类计算等功能。
6.数据查看和保存命令,查看原始数据,查看遗传距离,保存聚类图,保存矩阵和数据导出。
运行环境
1.硬件环境:
硬件名称最低配置推荐配置
1).CPU CPU 586奔腾P或以上或兼容芯片。
2).内存大于32M 64M。
3).硬盘可用空间大于1m和10m。
4).显示VGA真彩色超级VGA或液晶显示器。
2.软件环境:
操作系统:Windows95/98/Me/Nt/2000/Xp。
并且安装了Excel97及以上的办公软件,否则无法将数据导出到Excel文件。
3.推荐使用:Win2000或Xp操作系统Office2000。该软件已通过win98和win2000的测试。如果不能正常运行,请联系作者。
用户评论
聚类分析真是太厉害了!以前做数据挖掘总是很头疼,现在有了聚类分析,就轻松多了。感觉像把一堆杂乱的数据给分类整理了一下,能更好理解数据的本质特征,非常有用!
有14位网友表示赞同!
刚开始接触聚类分析,有点懵逼
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